第四步：原因—後果分析。
可分為如下步驟：
①確定核心問題：從分類整理的描述中選出一個能概括現狀的卡片，作為反映現狀的核心問題。
②因果關係分析：將核心問題放在展示板中間，將第三步得到的其他問題按照與核心問題的因果關係進行整合。屬於原因的放在核心問題的下邊，屬於後果的放在核心問題的上方。
③因果分析中可以對已經找出的問題領域進行補充和完善，直到參與者認為滿意為止。
④從上至下再做一次邏輯審查，最後用邏輯關聯線將所有的問題組裝成一個問題樹。核心問題為樹幹，原因為樹根，核心問題導致的後果為樹冠。
3.問題分析法優缺點
問題分析法的最大功能在於使參與者認清問題的原因與後果，為形成一致決策奠定認識基礎。參與者可以清楚看出鄉村基礎設施建設的重要性，很容易形成改善村內道路建設重要性的一致態度。除此之外，問題分析法還具有以下優點：
（1）係統性、開放性和靈活性 問題分析事實上是係統的邏輯思維方法，操作步驟上有很強的係統性，開放性和靈活性為不同層次的參與者提供了寬鬆的溝通環境。
（2）參與性 集思廣益書寫卡片以及主持人協調下的口頭發言，賦予每一位參與者同等的參與機會和權利。廣泛而有效地參與，是科學決策的基礎。
（3）內容的直觀性 展示板、卡片表述研討內容，可以幫助與會者對問題的理解和記憶，同時為形成研討文件提供了良好的資料基礎。
問題分析法也存在一些缺陷，主要表現為：
（1）耗時，成本高 本方法不僅需要一定的耗材，而且組織成本高，速度慢，需要較充足的時間。
（2）方法本身的局限 用簡單的問題描述，有時並不能完全準確的反映係統內的問題，而實際操作中，此方法往往難以做到精確和準確的描述。
（3）邏輯局限性 很多問題因果關係並不明顯，甚至存在互為因果的現象，這時就容易出現邏輯障礙。最為突出的問題在於有些問題的因果關係是十分隱蔽的，不是參與者靠直觀感覺或經驗就可判斷的，因此，該方法隻能為深入分析問題提供了素材，真正因果關係的理性判斷還需要研究人員的係統分析。
4.問題分析法應用中的幾個原則
（1）主持人的角色和中立原則 在村級調查階段，一般村級研討會不專門請外來的專家做主持人，通常是從調查小組中選出一位有協調經驗的人員擔任主持人，也可能是村幹部來擔任。在這種情況下，主持人在主持期間摒棄“專家”或“幹部”的角色，而隻扮演主持人的角色。主持人在研討中的角色不是決策者，不是領導者，也不是意見的主導者。其主要職責是：
①根據研討會的目的設計討論內容的框架；
②提出需要討論的問題；
③解釋有關的概念和背景情況；
④介紹參與的規則；
⑤保證所有與會者的參與；
⑥協助在有爭議的問題上達成共識；
⑦在有關問題上幫助作語言的歸納；
⑧把握研討的時間和進程。
主持人不能就問題發表自己的看法，也不能對與會者的意見發表讚同或否定性評論，否則，對研討進程和內容會起到主觀的誘導和幹擾作用。
（2）研討過程中平等參與原則 平等參與可以通過分組討論加以控製，但是無論如何分組，一組內成員的參與能力、表現欲望以及個性熱點都是不同的。這些差異可能導致參與的不平等。在問題分析過程中，特別是口頭發言中，行政層次高的“幹部身份”，知識、能力強的“專家”身份往往自覺不自覺的支配、主導討論過程和影響決策方向。“層次低”的農戶，特別是貧困農戶，女性代表參與機會往往減少。這樣，使參與式問題分析達不到平等參與的目的。為了避免“個體主宰”現象，主持人應在開始工作之前製定並宣布研討中的規則，對強者加以“限製”，對弱者“賦權”，保證平等參與。對個別特別沉默，不能參與的“弱者”要專門征求他們的意見，邀請他們發言。
（3）群體決策的原則 問題分析的參與者可能來自不同的部門或具有不同的發展要求或處在不同的社會地位，他們的需求不同，看問題的視角不同，對同一問題的敏感性和關注程度不同。討論中出現爭論和意見分歧是正常的，主持人應在問題分析的基礎上幫助參與群體成員達成共識。隻有達成共識才能使目標群體對決策方案和行動具有“擁有”感和責任的承諾，才有助於方案的通過和實施。共同決策是參與式問題分析的重要特點。