第三步，到2013年，基本建成南水北調東線一期工程。實現多年平均入下級湖29億立方米、入上級湖17億立方米的規劃目標。
三、實施安排
國家先期批複的5個單項、19個設計單元工程已全部開工，除南四湖水資源控製等邊界工程和截汙導流工程正在實施之外，其餘工程於2008年底已基本完成。其中，2002年12月開工實施三陽河潼河寶應站工程；2004年開工建設劉山站、解台站工程，2005年開工建設淮陰三站、淮安四站及輸水河道和江都站改造工程；2006年開工建設邊界調水工程藺家壩泵站；2007開工建設駱馬湖水資源控製工程及淮安、揚州（江都）、宿遷市截汙導流工程；2008年開工建設徐州市截汙導流工程，並開工建設南四湖水資源控製姚樓河閘、楊官屯河閘、大沙河閘工程，以及南四湖水質監測工程征地拆遷工程。
江蘇境內剩餘設計單元工程共計3個單項21個設計單元工程。按照南水北調“東線一期工程2013年全麵完成”的總體建設目標，根據江蘇境內工程建設安排總體思路、原則和2013年底全麵完成主體工程建設目標，未開工項目實施計劃安排如下：
2009年擬開工建設劉老澗二站工程，泗陽站工程，皂河一、二站工程，泗洪站工程，淮安二站改造工程，以及高水河整治、裏下河水源調整、駱南中運河影響處理工程，共9個設計單元工程。其中劉老澗二站工程已於2009年6月底正式開工；同時，治汙工程中剩餘5項綜合整治項目全部建成，全麵建成江都、宿遷市截汙導流工程，基本建成淮安市截汙導流主體工程，全麵實施徐州市截汙導流工程。
2010年擬開工建設金湖站、洪澤站以及金寶航道、洪澤湖抬高蓄水位影響處理、徐洪河影響處理、管理設施專項、血吸蟲北移防護工程，共7個設計單元工程；同時，全麵建成淮安市截汙導流工程，完成徐州市截汙導流工程主體工程。
2011年擬開工建設邳州站工程、睢寧二站工程以及沿運閘洞漏水處理、下級湖抬高蓄水位影響處理和調度運行管理係統工程，共5個設計單元工程；同時，全麵建成徐州市截汙導流工程，正式投入運行。
根據以上安排，運河線工程可於2011年完工，其他工程在2013年底前全部完工。
四、征地拆遷安置工作計劃
南水北調東線江蘇境內征地拆遷安置全線實物量已完成調查和複核工作，國土資源部已完成一期工程用地預審。三陽河潼河寶應站、劉山站、解台站、藺家壩站、淮安四站、駱馬湖水資源控製工程已向國土資源部辦理先行用地手續151.9公頃。已開工的三陽河潼河寶應站、劉山站、解台站、藺家壩站、淮陰三站、淮安四站及輸水河道、駱馬湖水資源控製、南四湖水資源控製工程的拆遷工作已經完成，累計完成永久征地1390公頃，臨時占地330.7公頃，搬遷人口9654人，拆遷各類房屋295639平方米，安置生產人口9265人，拆遷各類企事業單位105個，專項設施918處。未開工項目征地拆遷安置工作計劃如下：
2009年開工項目移民安置計劃共有9個設計單元工程，包括劉老澗二站、泗陽站、皂河二站、皂河一站改造、泗洪站、淮安二站改造、高水河整治、裏下河水源調整工程、駱南中運河影響處理工程，移民安置投資約114442萬元。
2010年開工項目移民安置計劃共有5個設計單元工程，包括金湖站、洪澤站、金寶航道、洪澤湖抬高蓄水位影響處理工程、徐洪河影響處理工程，移民安置投資約47663萬元。
2011年開工項目移民安置計劃共有5個設計單元工程，包括邳州站、睢寧二站、沿運閘洞漏水處理工程、下級湖抬高蓄水位影響處理工程，移民安置投資16194.7萬元。
五、投資安排
（一）分年投資安排
按照工程總體可行性研究及已經預審的初步設計投資，南水北調東線一期江蘇境內工程總投資約102億（元南四湖水資源控製、水質監測工程為江蘇省與山東省分半計列投資）。截至2008年底，累計完成投資約29億元。其中2003～2004年累計完成7.3億元，2005年完成4.5億元，2006年完成7.0億元，2007年完成5.5億元，2008年完成5.0億元。工程剩餘投資約73億元，根據工程總體實施計劃安排，2009年計劃完成投資10.0億元，2010年計劃完成投資22.8億元，2011年計劃完成投資21.4億元，2012年計劃完成投資13.5億元，2013年計劃完成投資7.5億元。
（二）分市投資安排
南水北調東線一期工程江蘇境內各市投資為：揚州市境內18.8億元，淮安市境內27.8億元，宿遷市境內20.1億元，徐州市境內22.8億元，鹽城市境內1.8億元，泰州市境內10.9億元。
截至2009年上半年底，已開工項目總投資37.8億元，各市投資為：揚州市境內12.9億元，淮安市境內9.4億元，宿遷市境內1.1億元，徐州市境內14.4億元。尚未實施項目總投資64.2億元，涉及揚州、淮安、宿遷、徐州、鹽城及泰州6市24個區縣60個鄉鎮。
揚州市境內實施高水河整治、金寶航道、裏下河水源補償、沿運閘洞漏水處理、江蘇省文物保護、血吸蟲北移防護、東線江蘇段調度運行係統管理係統工程及東線江蘇段管理設施專項工程，投資總計5.9億元。其中，永久征地250公頃，臨時占地325.9公頃，拆遷各類房屋79129平方米，安置生產人口1249人，拆遷各類企事業單位29個，專項設施112處，征遷總投資3.06億元。
淮安市境內實施淮安二站改造、金湖站、洪澤站、金寶航道、裏下河水源補償、沿運閘洞漏水處理、洪澤湖抬高蓄水位影響處理、江蘇省文物保護、血吸蟲北移防護、東線江蘇段調度運行係統管理係統工程及東線江蘇段管理設施專項工程，投資總計18.3億元。其中，永久征地421.9公頃，臨時占地291.9公頃，搬遷人口1958人，拆遷各類房屋51620平方米，安置生產人口2009人，拆遷各類企事業單位2個，專項設施88處，征遷總投資3.05億元。
宿遷市境內實施泗陽站、劉老澗二站、皂河一站、皂河二站、泗洪站、駱馬湖以南中運河影響處理、徐洪河影響處理、洪澤湖抬高蓄水位影響處理、江蘇省文物保護、東線江蘇段調度運行係統管理係統工程及東線江蘇段管理設施專項工程，投資總計19.0億元。其中，永久征地252.4公頃，臨時占地208.3公頃，拆遷各類房屋57382平方米，安置生產人口336人，拆遷各類企事業單位47個，專項設施16處，征遷總投資1.86億元。
徐州市境內實施邳州站、睢寧二站、徐洪河影響處理、江蘇省文物保護、東線江蘇段調度運行係統管理係統工程及東線江蘇段管理設施專項工程，投資總計8.3億元。其中，永久征地63.5公頃，臨時占地54.1公頃，拆遷各類房屋35831平方米，安置生產人口425人，拆遷各類企事業單位8個，專項設施6處，征遷總投資1.61億元。
鹽城市境內實施裏下河水源補償工程，投資總計1.8億元。其中，永久征地12.4公頃，臨時占地95.9公頃，拆遷各類房屋1320平方米，專項設施23處，征遷總投資0.44億元。
泰州市境內實施裏下河水源補償工程，投資總計10.9億元。其中，永久征地273.8公頃，臨時占地696.5公頃，搬遷人口3656人，拆遷各類房屋200834平方米，安置生產人口1414人，拆遷各類企事業單位156個，專項設施209處，征遷總投資6.58億元。