建設南水北調工程，事關國家和民族發展的長遠利益，任務艱巨，責任重大。江蘇境內工程作為國家南水北調工程建設的重要組成部分，其建設管理的複雜性、挑戰性都是以往工程建設中未曾遇到的。自2002年12月南水北調工程開工建設以來，江蘇境內工程認真貫徹落實國務院南水北調工程建設委員會曆次重要會議精神，按照國務院南水北調辦公室和江蘇省南水北調工程建設領導小組的決策部署，堅持以科學發展觀為指導，逐步形成確立了“統籌進度和管理，以項目管理為中心，以工程質量和安全為重點，著力強化規範管理、科學管理，突出管理創新、技術創新，又好又快完成工程建設任務，努力建設優質工程、高效工程、優美工程、廉潔工程；統籌建設和發展，合理配置利用資源，推進江蘇南水北調事業健康可持續發展”的建設管理新思路。
按照工程建設管理思路和建設目標，江蘇境內工程始終堅持重點項目突出抓，困難工作重點抓，複雜問題超前抓，合理分析建設條件，科學編製建設方案，統籌安排工程進度，加強目標管理，狠抓關鍵環節，及時排查化解矛盾，保證了工程順利實施，各項任務按計劃圓滿完成。在建設過程中，積極探索實踐南水北調新體製和新機製，著力加強管理創新和技術創新，形成了符合江蘇特點的建設管理模式，積累了很多好的經驗，新建工程投資可控、質量優良，得到有效管理，沒有出現一起質量和安全生產事故；大力推進重大技術及資源利用研究，率先組織開展建築與環境規劃設計，科技創新成果喜人，榮獲了一批部省級科技成果，已建成的泵站工程達到國內一流、國際先進水平；始終堅持兩手抓兩手硬，切實加強精神文明創建和黨風廉政建設，保證了“工程安全、資金安全和幹部安全”，湧現出一批先進集體和先進個人，樹立了江蘇南水北調良好形象。
通過6年的探索與實踐，國家先期批複工程已基本建成，列入國家考核的14個水質控製斷麵，有12個斷麵已基本達到Ⅲ類水標準。2008年12月，藺家壩泵站建成投入運行，標誌著江蘇境內工程已具備調水出省能力，取得階段性重要成果。
第一節 項目建設管理體係
南水北調江蘇境內工程點多、線長、麵廣，生產關係複雜，涉及調水、治汙、征遷移民等多方麵工作，協調難度大。妥善處理好工程建設過程中工程層麵與社會層麵的關係、主體工程與配套工程的關係、調水區與受水區的關係、工程建設與調度運營的關係，是實現工程順利建設的保障。江蘇境內南水北調工程遵循“政府宏觀調控、準市場機製運作、現代企業管理、用水戶參與”的建設管理體製指導原則，緊密結合江蘇境內工程建設的實際，以項目管理為核心，在《南水北調工程建設管理的若幹意見》的總體架構下，積極探索，建立了一整套適合江蘇境內工程建設需要的管理體係。
一、領導機構
國務院於2003年7月31日成立了國務院南水北調工程建設委員會，由溫家寶總理任主任，曾培炎副總理、回良玉副總理任副主任。2008年6月5日，國務院調整了建設委員會組成人員，由李克強副總理任主任，回良玉副總理任副主任。國務院南水北調工程建設委員會作為工程建設高層次的決策機構，其主要任務是決定南水北調工程建設的重大方針、政策、措施和其他重大問題。
2003年11月11日江蘇省政府第17次常務會議決定，成立江蘇省南水北調工程建設領導小組，由梁保華省長任組長，黃莉新副省長任副組長。2008年，省政府調整了領導小組組成人員，由羅誌軍省長任組長，黃莉新副省長任副組長。江蘇省南水北調工程建設領導小組主要任務是負責江蘇省南水北調工程建設管理中的重大問題的協調決策。
二、工作機構
國務院南水北調工程建設委員會下設辦公室，作為建設委員會的辦事機構，負責建設委員會的日常工作，對南水北調主體工程建設實施政府行政管理，主要職責是研究提出南水北調工程建設的有關政策和管理辦法，起草有關法規草案；協調國務院有關部門加強節水、治汙和生態環境保護。