這次重組使標準石油公司這樣一個龐然大物，激起了那些充滿了鬥誌的司法界精英們的憤怒。
1906年12月8日，距上次審判14年之後，美國聯邦政府再一次依照反托拉斯法，在密蘇裏州對標準石油公司提起訴訟，要求解散該公司。
在這個長長的名單中，有新澤西標準石油公司和它屬下的65個分公司及其高層管理者，洛克菲勒當然名列首位。
政府指控這些人壟斷石油業，並密謀運用不正當的競爭手段，包括收取鐵路回扣、濫用輸油管道壟斷權、製定掠奪性價格、刺控工業秘密及設立欺騙性的掛名競爭公司，並建議對這個壟斷組織予以全麵製裁，將其分解成為彼此獨立的公司。
起初，洛克菲勒和他的幕僚們對此並沒有特別地放在心上，以為這次訴訟與以往一樣，隻不過是一場法律上的遊戲罷了。不過，隨著事態的進一步發展，他們終於意識到了事情的嚴重性。
到了1907年，竟相繼有7個聯邦起訴和6個州的官司找上了標準石油公司。其中俄亥俄州法院為洛克菲勒羅列了939條罪狀，以控告其不可原諒的掠奪與欺詐行為。
雖然自19世紀90年代初，洛克菲勒已經逐步開始隱退，但他意識到，作為一個叱吒商界幾十年的風雲人物，他的退休生活不會有他渴望的片刻安寧。雖然這時的洛克菲勒隻不過是標準石油公司名義上的總裁，但還是不得不為整個公司的命運負責。
1907年7月6日上午，約翰·洛克菲勒和威廉·洛克菲勒一起來到聯邦法院大樓，那裏早已集聚了幾百個看熱鬧的人。當有人認出頭戴草帽、手裏拿著細長手杖的人就是洛克菲勒時，人群中出現了一陣騷動。
有一個流浪兒在人群中高呼：“那個人上過報紙。”洛克菲勒對人群報以微笑，並保持他一貫的沉著冷靜的作風。
進入法庭後，洛克菲勒開始了長達15分鍾的證詞陳述，他的發言顯得非常真誠，充滿感情，同時又含混不清，對指控撇得一幹二淨。
有位記者曾這樣描述當時的情形：“洛克菲勒先生是整個屋子裏表情最為冷靜的人。他的每一個動作都十分緩慢、莊重，他說話的節奏不徐不疾，在回答法庭提出的問題時語速更慢。”
對於法官的提問，洛克菲勒常常裝糊塗，回答說自己不記得或是想不起來。他回答所有的問題時都是遲疑不定，拖拖拉拉，前言不搭後語，這使得法官對他的證言產生懷疑，不敢采信。
負責這次審訊的蘭迪斯法官被搞得相當被動，雖然他明白洛克菲勒隻不過是在表演他的拿手好戲，但仍是沒有辦法。不得已，這位法官當庭宣布對洛克菲勒免於刑事訴訟。
不過，事情並沒有終結。一個月後，這位法官決定采取報複行動，在宣布對標準石油公司的判決書中，他用激烈的言辭指責其為無異於一個臭名昭著的竊賊，並指責標準石油公司的律師蓄意無禮。
最後，這位被激怒的法官宣布對印第安納標準石油公司處以2924萬美元的罰款，這一數額相當於如今的4570萬美元，比當年聯邦政府每年印製的貨幣總量的一半還要多。
據說，這筆數額驚人的罰款讓許多人大吃一驚。不管罰款的數額有多麼驚人，洛克菲勒還是以他特有的冷靜接受了。據報道，接到判決書的時候，這位石油大亨正在進行一場高爾夫雙打比賽，看完判決書後，他將它放進衣袋，提議比賽繼續進行。而且，那天洛克菲勒的狀態極佳，隻用53杆就打完了9個洞，是他得分最高的一次。
事實上，久戰沙場的洛克菲勒雖然具有在任何突發狀況中保持克製與冷靜的功夫，但他還是對這份判決書感到極端憤怒。他當天晚上發表了一份嚴厲譴責這一判決的聲明：
“本公司遭到了極為不公正的對待，這種不公正是由於他們根本不懂得大企業是怎樣建立起來的。這麼多年來，他們誰也不知道，似乎也不關心它是如何從無到有發展起來的。”
我們從中不難看出，洛克菲勒對做出這種裁決的法官的不滿，他認為自己花大半生心血締造起來的石油王國，被這些不懂商業規則的人肆意踐踏了。一向保持克製的洛克菲勒甚至尖刻地說：“不等到罰款付清，蘭迪斯法律就會完蛋。”
標準石油公司對這個判決進行了上訴，經過一波三折的訴訟程序，聯邦上訴法院駁回了罰款，並認為蘭迪斯的行為是濫用司法權限。
不過，洛克菲勒對上訴取得的勝利並沒有感到高興，因為他發現，自己的周圍似乎到處都是手執法律武器，想將標準石油公司這個龐然大物打倒在地的人。
顯然，要想完整地描述聯邦政府與標準石油公司長達10年的官司進程是相當困難的，所以我們不妨直接來看看事情的結果以及留下的印記。
1911年5月15日，聯邦法官懷特宣布了一份長達兩萬字的判決書，內容是解散標準石油公司並要求其在6個月內與子公司脫離，同時禁止公司原領導人重新建立壟斷地位。至此，這場美國商業史上最為持久的法律秀終於落下了帷幕。
這對洛克菲勒而言，的確是一個不小的打擊。他給自己昔日並肩工作的夥伴們發出了一封訃告式的充滿哀傷語調的信，信的開頭是這樣寫的：“親愛的朋友們，我們必須服從最高法院的裁決，我們曾經輝煌而快樂的大家庭不得不就此解散了。”
不過，後來的事實證明，雖然洛克菲勒在這場訴訟中輸了，但對他的個人財富而言，卻是一次飛漲，他所持有的原公司大約1\/4的股份，換算成了34家獨立子公司的1\/4的股份。
而且，隨著1911年12月1日這些公司開始在紐約股票交易所的上市，洛克菲勒的財富一躍而進入全美前10名。在短短的一個多月裏，這些獲得獨立地位的石油公司的股票狂漲了好幾倍，有人估計，洛克菲勒的財富從3億美元上升為9億美元，成為標準石油公司在本案件中最大的贏家。
有人說，對於些些精明的人，連上帝也會幫助他。自標準石油公司解體後的10年裏，各子公司的資產平均增加了4倍。洛克菲勒在退休後賺的錢，大大超過了他原先經商時的進賬。
洛克菲勒是一個幸運的人，這種幸運激起了許多人的不滿。不過，這些人手中的魔棒再也玩不出什麼花樣了，隻有眼睜睜地看著洛克菲勒的財富不斷增長，一舉超越卡內基而成為全球首富。
據說在當時的華爾街上，許多人的祈禱詞已經成了：“噢，仁慈的上帝，再賜予我們一次解散的機會吧！”