楊鎬猜到自己多半會被罷免，但也不想就這麼‘束手就擒’。
而且他清楚丁應泰的構陷之說大都來自陳寅帳下的周陛，隻要查到他與丁應泰之間暗通款曲，就不難證明丁的彈劾全是一派胡言。
於是他很快下令逮捕了周陛，並搜出了丁應泰通書蕭應宮曲護沈惟敬的書信，以及丁於周陛潛通的密書。
隻是楊鎬也未曾料到，他的舉動竟激怒了部分抱團的南兵，而差點引發兵變。由於長期的南北對立，楊鎬本身也處事不公，過於偏袒北軍，是以，陳寅都沒親自出手，原與周陛相善的南兵周冕糾集了一些浙兵將經理衙門圍困起來。
楊鎬則派了彭友德、許國威等擐甲勒兵以待，一時間，經理衙門前竟是劍戟森羅，其餘標兵則倉惶奔走。
後還是多方勸解，楊鎬才放了周陛，這事才算平息下來，隻是潛通密書等書信並沒還給周陛，楊鎬自己留下了。
周陛事後多少有些後怕，他知道丁應泰與他是脫不了幹係，那些信要是被楊鎬順藤摸瓜，再查出些什麼，恐怕不單自己，連帶陳寅也會受其牽連。
在慶州，丁應泰每夜邀陳寅入衙門議事，而陳寅交代他做的每件事，其實都是丁應泰所交代。
當然他也知道陳寅結交丁應泰，無非就是為升官發財，但誰不想呢？他也想。丁應泰是許過陳寅和他‘中路總兵’並‘進關許可擢用’，但升官總要有軍功，蔚山首功他是計不了，陳寅總可以吧？李如梅那小子就是運氣好，白撿一個功勞不說，那楊鎬還非要記他為首功，連麻貴標下的人都要退避三舍，憑什麼？就憑他楊鎬與遼東李家關係親厚？
周陛一想起這些，一想起楊鎬對他的懲戒內心就憤恨不已，都是戰場上賣命的，憑什麼關係好就要偏袒？既要偏袒那就怪不得他在丁應泰麵前說盡他楊鎬的‘壞話’，誰叫他處事如此不公？李如梅也肯定要拉下馬。
雖然周陛覺得有足夠理由這麼做，但又想到那些書信，內心始終惴惴不安，惟一盼望楊鎬快點下台。
楊鎬在南軍中口碑不好，但在朝鮮君臣心裏，楊經理可是親愛的思密達。除了他自己上自辨疏外，刑玠及監軍陳效均上疏替他說話。除此，還有吳惟忠、茅國器、許國威、李芳春等東征大將亦紛紛上疏，請留楊鎬。
許國威親自寫信給朝鮮君臣，並希望他們急遣重臣一次上本，再次上本，不須辨明楊都爺被誣之事，但說他是一心擔當，銳意殺賊，無論罪之虛實，著令仍任管事，觀其殺賊與否，再查功罪，亦未晚矣。
朝鮮君臣本也有意替楊鎬辯解，當初李德馨找楊鎬談話其意就欲為他辯解。後來國王李昖與柳成龍、李德馨、李元翼等十一名官員還專門為此商議過，最終決定派人前往北京遞交奏辨疏。
七月初一，朝鮮辯解使臣陳奏官崔天健、書狀官慶暹便出發前往北京為楊鎬辯解。並希望天朝皇帝萬曆繼續留任楊鎬，並奏請不要撤兵、撤餉。
三天後，聖旨到，曰：“東征獨遣經理，經理、監軍等官，責任甚重。轉調兵餉，月無虛日，冀收全勝，以安外藩。乃輕率寡謀，致於喪師，又朦朧欺罔，奏報不實，法紀何在？楊鎬革任回籍。且將士被堅執銳，臨敵對壘，不避寒暑，倏爾死生奏報不實，俱候勘明處分。”
隨後，朝鮮官員即上奏李昖：“經理被參，事機將敗，國家存亡，迫在朝夕啊！”此番語氣已比之前急迫許多。
“大人所言極是，那依你之言又該如何？”其實李昖聽到聖旨那刻，內心早就拔涼拔涼。
“大王，自然應該差遣大臣，急急申理請留，不可一刻少緩。崔天健之行雖已發去，非但使臣秩卑，事體不重，一介行李，尚未伸請便大事去矣。如今我國需再次更遣大臣，陸續懇乞，庶可取信天朝，翻轉事機，而與我國請留之道，亦為無憾！”
此刻李昖也知道，若不派人再向明國申理，恐再無還轉餘地。於是他立馬吩咐：“快，傳李元翼來……”
七月十一，一切塵埃落定，楊鎬也準備啟程回國。
自接到聖旨那刻，他已脫下一身官府，自覺換上了布衣、布巾。李德馨見他形容枯槁，一身孝子打扮，心中亦是難過。來時起複，將官威儀，去時回籍，孝子衰麻——嗚呼哀哉！
國王李昖知道楊鎬今日啟程，親自來到弘濟院為他餞行。
“楊經理思密達，小邦唯大人是仰，大人不意旋歸，小邦何所依賴？今日無以為懷，不知所言……”
還未說完，李昖竟難過的不能自已，嗚咽起來，一時涕淚橫流，左右侍臣見之，莫不掩麵哭泣。而楊鎬標下，同樣相顧淚眼。