這一次檢查，非常嚴格、認真。
曹醫生為了檢查彭加木的上腔靜脈情況，進行了血管造影。為了注射造影劑，所用的針頭比較粗。造影劑是從手臂上的“貴要靜脈”打進去的。由於彭加木多次注射氮芥，以致手臂的靜脈血管壁比較硬，針頭滑來滑去，紮不進血管。曹醫生急得汗水、淚水一起流了下來，彭加木卻一聲不吭，麵不改色，鼓勵曹醫生道：“不要緊，慢慢打，再換個地方打。”另外，曹醫生還抽取了彭加木的骨髓，進行細致的化驗。
沒想到，幾天之後，中山醫院通知彭加木——住院治療！
彭加木預感到可能是病情惡化了，不得不住進了中山醫院。
發現了什麼異常情況？原來，曹醫生在做了血管造影之後，發現彭加木上腔靜脈嚴重阻塞。更使她吃驚的是，在彭加木的骨髓塗片中，查出了少數“異常網狀細胞”，推斷他可能患有“網狀細胞性淋巴瘤”。
“網狀細胞性淋巴瘤”，是一種更為危險的惡性腫瘤。醫學文獻指出，這種惡性腫瘤患者，除了特例之外，一般隻能活三個月。
彭加木又一次麵臨著死神的挑戰。
彭加木向曹醫生打聽，自己究竟又患了什麼嚴重疾病？這一次不同了，經過曹醫生與組織上商量，認為彭加木經受過四年前那場生死考驗，他的毅力是驚人的，可以把病情告訴他。
彭加木知道自己剩下的時間不多，便更加抓緊工作。……
三個月過去了，彭加木依舊活了下來。當醫生和護士向他投來驚異的眼光時，他風趣地說：“我是不會死的！死了閻王爺也不敢收留！”
他一出院，又投入了緊張的戰鬥。當時，上海正在舉辦全國性的“高級生物化學訓練班”，彭加木主動要求擔任輔導工作，經常忙到深夜。
這時，中國科學院綜合考察委員會領導得知彭加木又一次瀕臨險境，為了他的健康，勸他調離中國科學院綜合考察委員，在上海安排適當工作。彭加木卻念念不忘新疆，在1961年4月18日複信中國科學院綜合考察委員辦公室的領導：
我在醫院查的問題主要有兩個：一是上腔靜脈阻塞，一是在骨髓檢查中發現少數異常網狀細胞，有患網狀細胞瘤的可能。
網狀細胞瘤是一種比較討厭的病，病情的發展常常是快的，往往在一兩個月之內可以達到十分嚴重的地步。現代醫學尚無根治此病的方法……
我目前病情幸而尚無顯著的發展。
……餘留下來讓我能繼續工作的時日，恐怕未必會有很長久。按一般而論，似目前狀況再維持一兩年或三五年，即屬十分罕有的例子，如不能善於利用此短促時光，為社會主義建設多盡一份力量，實堪惋惜，內心亦常為此焦急不安。
現在天氣已經轉暖，新疆地區的氣候亦已將成為我可以在該地區工作的季節，未悉我現在是否可以前往新疆的準備？
經過中國科學院綜合考察委員與上海生物化學研究所領導共同研究，考慮到考察隊的生活異常艱苦，彭加木的身體已不能適應，決定自1961年4月底，把彭加木調回上海生物化學研究所工作，戶口也由北京遷回上海。但是，領導上也考慮了彭加木再三要求赴邊疆的強烈願望，同意彭加木在身體允許的情況下，在合適的季節中，去新疆工作幾個月。1961年夏天，彭加木又奔赴新疆了。從此，他不顧身患重病，每年夏天差不多都抽出三個月的時間，堅持去新疆工作。有一次他去南疆考察生物資源，一連坐了十六天汽車，終於翻過了高聳入雲的天山。盡管他是咬緊牙關才度過那漫長而艱辛的十六天，但他為自己闖過了這一難關而感到無比歡欣。
征服“科學之眼”
我沒有聽彭加木同誌說過“難”字，也沒有見過他開過空頭支票。隻要工作需要，他就有這麼一股子勁——總要細心探索，刻苦鑽研，不徹底解決不肯罷休。當電子顯微鏡安裝後驗收時，由於國內還沒有鑒定高分辨率技術的經驗，我們受了不少肮髒氣。為了永遠擺脫這種被動情況，為了對人民負責，看看這台儀器的鑒別率到底是多少，是否符合廠方所開列的規格，彭加木同誌硬是花了一個月的功夫，通過頑強的探索，掌握了鉑銥粒法，測出了儀器的鑒別率。這僅僅是他刻苦鑽研業務技術的許多事例中的一個。
以上，是上海生物化學研究所曹天欽教授在回憶彭加木的文章中，所寫的一段話。
彭加木是學農業化學的。當他在中央大學農學院讀書時，別說沒摸過電子顯微鏡，連看都沒看過哩！
他，怎麼會跟電子顯微鏡打上交道呢？
原來，1962年，當他在上海休養期間，上海生物化學研究所進口了一台高分辨率電子顯微鏡——當時國內的第一台。由於沒有經驗，在安裝、調試工作中，遇到許多棘手的問題。彭加木一聽說，盡管他自己也是第一次接觸這種新技術，卻知難而進，主動求戰。領導上同意了，派彭加木主持建立電子顯微鏡實驗室的工作。電子顯微鏡是一種嶄新的現代化科研工具。
人們常常把自己的眼睛稱為“肉眼”。人的眼力不夠，肉眼隻能分辨大小為0.1—0.2毫米左右的東西。
自從在16世紀出現了光學顯微鏡，微觀世界的大門自此被打開。人們用光淡顯微鏡把物體放大幾十、幾百倍，發現了微生物和細胞。恩格斯在《自然辯證法》一書中，把細胞的發現稱為19世紀的三大發現之一。
不過，光學顯微鏡的放大倍數最大隻有1500倍左右，最高分辨本領大約為2000埃。一埃，就是1/1，000，000厘米。