除了治療營養缺乏病的藥物以外，孫思邈對一般藥物，也很注意研究。例如他用白頭翁、苦參子、黃連治療痢疾，甩常山、蜀漆治療瘧疾，用檳榔治絛蟲，用朱砂、雄黃來消毒，都有很好的效果。他的著作中，列舉了六百多種藥材，其中有二百多種，都詳細地說明了什麼時候可以采集花、莖、葉，什麼時候適宜於采集根和果。要不是他花費了艱巨勞動和苦心研究，是不可能得到這樣大的成績的。
重視婦嬰和預防、保健
孫思邈特別注意婦女和小孩疾病的醫治。他在自己的著作中說：沒有小孩就沒有大人，如何把小孩撫育好，是很重要的問題；我的書首先講婦女和小孩的疾病，然後再講成年和老年的疾病。孫思邈特別指出，婦女的病和男子的病不同，小孩子的病和成年人的病不同，要大家特別加以注意。孫思邈並且主張小兒病和婦女病都應該另立一科，後來婦科、小兒科醫學理論和醫療技術的發展，證明孫思邈這一主張的正確。
孫思邈說，孕婦不能受驚，臨產的時候精神要安靜，不能緊張，接生的人和家裏的人都不能驚慌，或者流露出憂愁或不愉快的情緒。他認為這些都容易引起難產或產婦的其他病症。他指出，嬰兒生下來以後，要立刻擦去小嘴裏的汙物，以免窒息或者吃下去引起疾病。嬰兒生下來如果不哭，就要用蔥白輕輕敲打，或者對小嘴吹氣，或者用溫水給他沐浴，一直到嬰兒能哭出聲來為止。這一切都是合乎科學的。
關於撫育小孩，孫思邈主張衣服要軟，但不能太厚、太暖。要把小孩時常抱到室外去曬曬太陽，呼吸新鮮空氣，否則小兒會像長在陰暗地方的花草，身體一定軟弱。小孩吃東西也不能過飽。孫思邈還對選擇乳母的條件，哺乳的時間、次數和分量，以及其他種種護理方法，作了說明。孫思邈這些見解，到今天都還有一定的實踐意義。
此外，孫思邈書中對於如何處理難產，如何治療產前產後的並發症，也有詳細的說明。他對於胎兒和小兒的發育程序的記載，也是很正確的。孫思邈在醫學上的貢獻，除了上述的一些以外，在針灸方麵，他繪製了《明堂針灸圖》，對針灸的孔穴加以統一。他並且強調針藥應該並用。他說：針而不灸和灸而不針，不是好醫生；針灸而不藥，或藥而不針灸，也不是好醫生，針藥並用，才是良醫。這種用綜合治療方法來提高醫療效果的思想，扁鵲和華佗都很重視，孫思邈則特別加以提倡。這種思想，今天已得到了很大的發展。
孫思邈還曾經用瘋犬的腦漿來治瘋犬病。這就是所謂“以毒攻毒”，也就是用毒物和病菌來增強人的抗病力量以戰勝疾病的方法。這與後來用種牛痘來預防天花，接種卡介苗防止肺結核，以及用其他種種疫苗來預防疫病，是同一個道理。
講求衛生、預防疾病，也在孫思邈的醫學思想上占著重要的地位。在《千金方》裏，孫思邈就曾經介紹用蒼術、白芷、丹砂等來消毒的方法，以防止疾病的傳染。他也告誡人們不要隨地吐痰，注重公共衛生。而特別注意於節勞和飲食。孫思邈說：人一定要勞動，但不要過分疲勞。又說：吃東西要嚼爛、緩咽，不要吃得過飽，飲酒不能過量，肉要煮爛再吃。孫思邈還勸大家飯後漱口，睡眠時不要張著口，不要把頭蒙在被子裏睡，不要在爐邊或露天睡眠等等。孫思邈後來活到一百零一歲，這同他注意衛生有很大的關係。
人民對孫思邈的崇敬
孫思邈也與扁鵲和華佗一樣，受到人民的崇敬和深切的懷念。因為他是一個傑出的藥物學家，後人尊稱他為“藥王”，而且把他曾經隱居過的五台山稱做“藥王山”。在他的故鄉建有紀念孫思邈的祠堂，祠裏有孫思邈和他父母的塑像。藥王山上也建有藥王廟，廟裏有相傳是唐朝人拜孫思邈的“拜真台”和孫思邈隱居的石室——太玄洞，洞裏還有他的塑像。太玄洞旁邊的一個亭子，還有八塊“千金寶要碑”，刻著《千金方》的一部分藥方，那是宋朝時候刊立的。