洛克菲勒盡管在事業上蒸蒸日上，但他心裏明白，任何一個成功的企業家是不可能靠自己單獨的力量取得巨大的成功的，他需要一個與他思想接近、支持他並心甘情願做他的副手的人。
雖然弟弟威廉對他忠心耿耿，但他仍需要借助外來的力量，將事業往前推進。洛克菲勒這個希望真的如願以償了，他很快便遇見了事業上的知己。此人名為亨利·莫利森·弗拉格勒，比洛克菲勒年長9歲，他性格活潑，精力旺盛，同時對自己的想法和身世都諱莫如深。亨利與洛克菲勒性情不同，各有擅長，但他們能彼此欣賞，成為一對互補型的事業夥伴。
亨利認為建立在生意上的友情勝過建立在友情上的生意。對此洛克菲勒相當讚賞，他們的友情就是在共同的生意中建立並深入發展的。他們一起上下班，一起回家吃午飯，再一起回公司，晚上又一起回家。他們經常一邊走路一邊討論公司裏的事。
在辦公室裏，他們相背而坐，共同處理事情，甚至於共同撰寫同一封商業信函，然後再交換初稿，做一些細小的改動，直到雙方都滿意為止。能遇到這樣的朋友與合作者，對洛克菲勒而言，比賺到一大筆錢更有意義，而且，亨利給洛克菲勒帶來的，還遠不止這些。
由於龐大的資金需求，洛克菲勒已經從銀行借貸了大量款項。但他對靠這種借貸的狀況並不滿意，於是將眼光投向了個人投資者。
南北戰爭結束後，出現了一大批暴發戶，這些人手裏擁有可觀的資產和現金，他們正在尋找有利可圖的項目。經過亨利的介紹，洛克菲勒從當地富豪斯蒂芬·哈克尼斯那裏獲得了投資。此人在戰爭期間靠囤積貨物發了大財。由於對亨利的特殊信任，哈克尼斯同意投資10萬美元，而且並不要求洛克菲勒以貨物作為抵押。
他的條件是讓亨利作為自己的監督人，出任公司的財務主管。這當然是洛克菲勒求之不得的。由於哈克尼斯的幫助，洛克菲勒與銀行、鐵路、礦業等行業的業務聯係更進了一步。
有了亨利的加盟與協助，洛克菲勒如虎添翼。他們兩人都雄心勃勃，絕不滿足於眼前的小小成就，都想著盡可能地利用各種資源，將企業盡快發展壯大。
洛克菲勒從這個新合夥人身上獲益匪淺，亨利的樂觀與熱情，深深地影響了洛克菲勒。在以後的幾十年裏，他們一直保持著極佳的合作與友情，這與洛克菲勒以前幾個合夥人的關係完全不同。有人說，對洛克菲勒而言，亨利·莫利森·弗拉格勒是上帝的禮物。
石油從開采、提煉到使用，其間往往要經過長途運輸。可以說，運輸一直是製約石油開采業的一個瓶頸。如今，世界各國都建立了高效的輸油管道，通過四通八達的網絡將原油源源不斷地輸出。可是，如今的人們一定很難想象，在100多年前，曾經有過怎樣一段利用馬車運送原油的曆史。不過，在馬車運輸之後的很長時間裏，一直是由鐵路公司主宰著石油的運輸。
洛克菲勒創業的克利夫蘭市地處交通樞紐，鐵路四通八達，這讓洛克菲勒在與鐵路公司的談判中多了一些籌碼。洛克菲勒和弗拉格勒運用高超的技巧和才智，不斷迫使鐵路公司降低價格。當時，經過克利夫蘭市的鐵路主要有三條：紐約中央鐵路、伊利鐵路、賓夕法尼亞鐵路。洛克菲勒利用其高超的商業技巧，以最優惠的價格讓鐵路公司運送自己的石油。
當時，在克利夫蘭市的石油運輸業裏，賓夕法尼亞鐵路公司占有壟斷性的地位，由於其鐵路通往重要的開采基地——匹茲堡，該公司便利用其優勢，向匹茲堡的各煉油廠索取高額的運費。
為了鞏固自己的霸主地位，賓夕法尼亞鐵路公司利用各種手段，來削弱克利夫蘭市的煉油中心地位。他們聲稱，克利夫蘭市的地位將被匹茲堡所取代。
這種說法一度引起了極大的恐慌，許多煉油廠的老板甚至想到搬遷工廠。不過，洛克菲勒一向頭腦冷靜，他一眼就看穿了賓夕法尼亞鐵路公司打擊競爭對手的目的。他認為，自己能很好地利用這次機會，把壞事變成好事。
洛克菲勒和弗拉格勒在與中央鐵路公司的談判中，得到了比賓夕法尼亞公司給客戶開出的運費折扣更為優惠的價格。他們巧妙地把自己的劣勢變成了優勢。
當然，洛克菲勒與弗拉格勒並非是一味地用賓夕法尼亞公司來威脅這兩家公司並逼迫他們降價的，而是提出了十分誘人的條件作為回報。他們承諾向鐵路公司提供每天60車次的驚人運量。
以當時洛克菲勒的煉油廠的產量而言，他遠不能提供如此之高的貨運量。不過，他認為通過和本地其他煉油廠的協調，他一定能滿足自己向鐵路公司開出的運量。就這樣，洛克菲勒讓每桶油的運費從2.4美元降到了1.5美元。
雖然很多人對洛克菲勒的做法不滿，但不可否認的是，無論是克利夫蘭市的煉油廠還是鐵路公司，都從這筆交易中獲益匪淺。鐵路公司獲得了穩定的運量，降低了運輸成本，進而增加了收益。而煉油廠從降低的運費中得到了直接的實惠。
由於與鐵路公司的協定，使得克利夫蘭市很快超過匹茲堡而成為主要的煉油中心。而洛克菲勒作為年輕的石油大亨，也奠定了無人能夠撼動的重要地位。