殺死張善安後，皇帝便下詔，各道諸郡，全麵推進軍改、稅改，全麵考核官員，能者上，弱者下。
此時朝廷名義上一統下，除了江東、江西、湖南三道還未平定，其餘各地皆已掃平。
安東、遼寧、河北、定襄、朔方、河東、山東、河南、淮南、關中、隴右、河西、巴漢、湖北、劍南、雲南、黔中、廣東、廣西、廣南，實際統有二十道，劃為二百零八郡，縣一千零十五。
樞密院和兵部拿出的軍改方案是實行府兵製的同時，再增加了禁軍係統。
禁軍編設左右神策左右神威左右神武，和左右神機左右神捷左右神勇，共十二軍，每軍兩萬四，共計二十八萬八千人。
他們稱為北衙十二軍，負責拱衛六京，宿衛皇城，隨扈皇帝。十二軍主要駐於六京，同時也輪流到邊疆駐守，並且遇一般的戰事、叛亂，優先抽調禁軍出征。
除這北衙十二軍外，原府兵十二衛四府，依然保留，十二衛為左右驍衛、左右武衛、左右翊衛、左右屯衛、左右侯衛和左右禦衛，十二衛統領南衙府兵，下各道設立軍府，編額五十七萬六千，每衛編有四萬八千。
此外南衙還有四府，四府為金吾衛府、千牛衛府、備身衛府、監門衛府。此四府不統外府兵，隻統皇帝近身侍衛以及宮門守衛。
另外還有內軍十二軍府，內軍則是親勳翊三衛六軍府，以及東宮親勳翊三衛六軍府，內軍皆由貴族勳戚官員子弟充當。
整個大秦軍隊體係很清晰明確，規模也十分龐大，達到百萬之眾。
其中南衙府兵是屬於戰時為兵閑時為農的農兵一體，而禁軍體係，則是募兵製下的常備軍職業兵體係。
主要是從府兵中精選的年輕精銳之兵，他們當兵拿餉，職業軍人。
至於南衙四府，則是府兵番上宿衛。
而內軍，則是勳戚官員子弟充當，這些人充當皇帝的侍衛同時，也相當於是武官培訓。
沒有全麵繼承隋朝的府兵製，是因為大秦的國策是要不斷開疆拓土的，因此必須有常備軍，而不搞全麵募兵製，則是因為全麵募兵製軍費太高，大秦也吃不消。
所以北衙禁軍和南衙府兵，其實就相當於是兩級軍製，一般情況下，有北衙軍就夠了，若是戰事規模擴大，或者內部叛亂的情況下，則開始征召府兵補充。
北衙軍由皇帝直接統領，而南衙軍由宰相負責。樞密院、兵部、十二衛、十二軍分別掌握軍令、軍政、統兵等職權。
一般情況下，大秦朝廷隻需要供養北衙的十二軍以及南衙四府和內軍即可，軍費開支降低同時，秦軍的戰鬥力又能保持。
而將來分封諸侯後，各諸侯國內的駐軍，也一樣還是在南衙十二衛府裏抽調兵馬，在其兵額之內。
南衙十二衛主將稱大將軍，北衙十二軍主將則稱上將軍，品級皆為正三品。
四府和內軍二十軍府主將，則稱為中郎將，品級正四品。
軍改內容巨大，隨之而來的也將是全軍範圍內的一次巨大將領對調。
十二位南衙大將軍，十二位北衙上將軍，四位南衙中郎將，十二位內軍中郎將，再加上二十位左都督指揮使和二十位右都督指揮使，這麼多職位，誰能上，誰不能上，足夠讓皇帝和宰相們頭痛許久了。
好在有輔公祏的前車之鑒後，皇帝和宰相們相信，軍改應當會比較順利，不會再有人腦子發昏亂來了。