“兄長的說的很對，羽茂本間氏的本間高信是為忠臣，但本間一族涉足海盜卻是不爭的事實，隻要本間高信與本間一族內保持中立，本家也不打算為難他們，但是掌管佐渡水軍的河原田本間氏絕對不能放過，北陸附近的海域絕不允許出現海盜。”
吉良義時已經下定決心處置本間家的水軍，甚至為此想好策略以此仿製長尾景虎阻撓，再三保證絕對不會觸碰本家氏宗家雜太本間氏，以及親長尾的羽茂本間氏。
這河原田本間氏仗著有水軍之利，一直對宗家雜太本間氏不太恭順，隨著雜太本間氏衰落而丟棄大部分領地，使得佐渡島內呈現河原田與羽茂兩支分家南北對峙的局麵。
河原田城城主的本間実宣，就曾多次與羽茂城城主本間高信火並過，在此之前本間実宣依托揚北眾的親善關係，以及水軍的掠奪穩穩壓製本間高信，但本間高信有長尾景虎的支持，使得本間実宣也不敢輕舉妄動。
五月十五日，吉良水軍傾巢而出與傍晚埋伏在信濃川出海口附近的蘆葦叢內，午夜十分趁著月色明亮，九鬼重隆摸黑潛入佐渡港，而港口內安歇的佐渡水軍還懵然不知一場災難即將降臨。
作為相應吉良家的配合，雜太城城主本間山城守泰高、太田城城主本間秀氏、久知城城主本間與十郎、吉田城城主三川為雄、沢根城城主沢根高秀、潟上城城主潟上秀光等佐渡國人，聚集起了一千軍勢於當夜發動突襲攻擊本間実宣的河原田城。
這一次大半個佐渡島上的國人都團結起來攻擊，吸引了佐渡島北部的大部分軍勢，在佐渡港內酣睡的本間実宣依然毫不知情，此時本間高信已經率領三百軍勢摸到港口外邊，隻見昏暗的港口突然亮起一束束火光，黑暗渾濁的海水在月色下，照亮一片火紅詭異的倒影，如同飄蕩在地獄中的一簇簇惡靈火焰。
“啊！”一名打瞌睡的哨兵被一劍封喉，拉響了夜襲戰的號角，酣睡中的本間軍被雜亂的叫喊聲吵醒，赤紅的火焰將港口的許多房屋吞沒，那裏儲藏著最近幾個月搶來的貨物。
“是火箭！敵襲！”
本間実宣匆忙穿起衣衫，也顧不得屋內女人裸露著身子大聲尖叫，急切的喚來旗本武士急聲問道：“怎麼回事？誰來打我們？”
“主公！我們也不清楚！但是有好多艘船啊！他們有火箭和鐵炮，正在攻打我們的港口！”
本間実宣咬牙切齒的痛罵道：“混蛋！一定是他們！隻有他們才有鐵炮！”
這時一名身材高壯的武士，急匆匆的跑過來道：“兄長！我們該怎麼辦？”
“実兼！你來的就好！本家要反擊他們！一定得把他們打回去！哪怕從河原田城調兵也要把他們打回去！”
“是！我這去調兵！”本間実兼轉身便要離去，卻被本間実宣攔住，皮笑肉不笑著說道：“実兼不是一直想做大將嗎？這次本家就命你擔任大將，抵抗這支入侵軍，本家去河原田城調兵即可。”
“這個混蛋想讓我送死！”本間実兼暗罵一句，卻還得硬著頭皮裝作感激涕零著致謝：“兄長請放心，我実兼絕不會讓他們攻破佐渡港，請兄長快快派來援軍！”
“嗯，辛苦你了！”本間実宣轉過身朝身後的旗本打個眼色，後者偷偷摸摸的跑回那間屋子把那女子一起攜上馬帶回去，這女子是前幾日從一艘前往出羽的客船上劫掠來的貴族女子，能讓本間実宣見而忘形，不顧規矩的劫走人質還是十分少見的事。
本間実宣萬萬沒有料到，吉良水軍的火力竟然這麼猛，前後兩刻鍾就攻破佐渡港，本間実兼都沒來得及投降就被一陣集火給亂槍打死，逃跑還不望帶著女人的本間実宣也落入本間高信的伏擊圈中中箭身亡，從頭到尾都沒意識到自己會死在港口外的小路上。
第二天一大早，登陸作戰的吉良水軍與本間高信合為一千八百軍勢，朝河原田城發起攻擊，在猛烈的火力壓製以及家督戰死的重重打擊下，河原田城開城降服，佐渡第一大勢河原田本間氏就此消亡，佐渡島內一場巨變就此劃上圓滿的句號。
本間家的家領被幾個家族聯手吞並，本間高信憑借出色的表現獲得其中一半的領地，其他的一半被參戰的另外幾家共同分享，吉良家獲得佐渡港以及附近一千五百町步土地的所有權，同時作為國主也將自然獲得還有佐渡境內所有礦山的所有權和開采權。
對於吉良家的判定本間氏沒有意見，佐渡島內早就傳說山上有金子，但苦無開采冶煉技術不會采掘也不會冶煉，幾年前本間実宣聽說這個傳聞就霸占鶴子金山，用海上抓來的人丁充作奴隸胡采亂挖，最後挖出一些很像銀礦石的東西又不會冶煉，隻能丟回去封鎖消息。
結果便宜吉良家也是無可奈何的事情，好歹他們還能獲得領地增加的安慰也不算太虧，吉良義時對他們保證會盡快給予更好的待遇，佐渡島上也可以在吉良家的指導下種植新糧。
年過六旬的蘇我太兵衛再次出山，帶著幾個新收的徒兒奉命前往佐渡金山做探礦工作，這幾年蘇我太兵衛也沒怎麼閑著，銅屋與鐵匠屋用不著他操心，就帶著幾個徒弟翻遍越後所有山巒，大致摸清哪些地方存在礦脈。
用他的話來說，越後是個風水寶地，具體怎麼寶地他也沒敢說大話，隻是說等幾年就會有結果。
從初春到仲夏，整個越後都在忙著土地改良，佐渡島上一場小小的水戰並沒有改變人們的重視，很快李定的新方案就新鮮出爐，在信濃川開挖兩條支流，阿賀野川開挖一條支流用意分水灌溉，同時兩條河川之間另外開挖一條運河連接在一起，承擔水上運輸的重任。
這個計劃十分龐大，其中包括修建運河、開挖支流、修築圩田、清理幹潟、改善土壤沙化等多項複合工程將同時進行，預計動用的人工將超過五萬人，不排除未來擴大雇傭的可能性。
工期分三個階段，第一期為挖掘名為“新堀川”的運河同時興建圩田，第二期開挖支流分洪繼續興建圩田，第三期清理幹潟改良土地，第一期與第二期將在五年內陸續完成，第三期預計需要十年到二十年的時間。
此計劃的規模之宏大遠遠超過吉良義時的想象，不算人工費酬勞等費用，先期投入就高達永樂錢十萬貫文，預計總投入將突破永樂錢五十萬貫文，並不排除增加額外預算的可能。