第三、改製時的會計問題
改製時，需認真做好清產核資和賬務梳理工作，同時必須選擇適合公司情況的會計政策和會計估計，規範關聯方交易行為，建立健全內部控製製度。
首先，規範曆史賬務處理。民營企業在發展初期，往往資產總額較小，注冊資本偏低，資產負債率較高，因此，部分民營企業由於經營不規範或者對政策理解上的偏差，有意或者無意虛增長期資產或實收資本，甚至是虛假出資或抽逃注冊資金。
對於長期資產，既需要檢查其曆史形成和賬麵構成情況，也需要檢查相應的所有權是否屬於公司。通過賬麵價值和權屬的詳細審核，夯實資產，提高資產質量，使改製後的企業經營更加規範。
其次，選擇會計製度和會計政策。民營企業實施股份製改製後，應執行現行會計準則，並選擇符合公司實際情況的會計政策和會計估計，做好賬務銜接工作。改製前的會計年度需重新按現行會計準則編製比較報表，經營業績和財務狀況也可能與改製前執行行業製度的報表存在較大差異。
再次，對產權不明的資產的處理。股份製改製的目的之一就是明晰產權，必要時應請政府部門按照有關規定進行產權界定。在政策法規或財政主管部門沒有明確規定之前，國家扶持基金作為一項特殊的所有者權益，在改製時不宜折為股本，避免以後可能產生的股權糾紛或出資不到位的嫌疑。
此外，改製基準日到股份公司成立日的特殊賬務處理。在改製基準日後、股份公司成立之前，資產仍歸改製前股東所有，改製基準日至股份公司成立日這一持續經營期間實現的利潤理應歸改製前股東所有。為了支持公司的發展，改製前股東往往將該部分利潤留在改製後的公司。若該期間企業經營發生虧損，則由原股東在股份公司成立日之前予以補足。對於以資產評估結果調賬的公司，在評估基準日至公司成立日之間，一般應按評估後的資產價值計提折舊或進行攤銷。
最後，關聯方交易的安排。在市場經濟環境中，關聯方交易是不可避免的。民營企業改製後應迅速理清關聯方關係，對關聯方交易要遵循程序合規、定價公允、披露充分的原則。關聯方在股東大會或董事會就關聯方交易問題進行表決時應當回避，關聯方不得以任何形式幹涉公司的決定等。關聯方之間的交易必須符合誠實守信的原則，定價必須符合一般商業慣例，以不損害股份公司的利益為原則。