（十六）邊界地區與外方連接，對於當地人民之管理，來往行人之檢查，都屬重要事務。過去知能較強之宗本多留拉薩供職，而派知能較弱之宗本前去邊界，難免耽誤事情。今後邊宗宗本均由小宗本及軍隊頭目中選派，任滿二年後考查成績，如果辦理妥善，駕馭得宜，記名以代本等缺升用；倘辦理不善，立即革退。
（十七）西藏過去委任大小職務，均在貴族中選任，平民完全無份，自今新立規章，凡普通士兵如有知能較強並有戰鬥能力者，雖非貴族亦得升任定本甚至逐級升至代本。其他一切官職，可依舊例從貴族中派任，但如年齡過幼，亦不宜擔任官職。因此規定小秘書、噶廈仲尼、小宗本等，年滿十八歲之貴族子弟始可派任。
（十八）堪布為各寺院之主腦，應選學問淵博，品德良好者充任之，近查各大寺之活佛，擁有很多莊園，並因享有群眾信仰，所獻貢物者很多，再加經商謀利，貪財好貨，甚不稱職。現規定今後各大寺堪布活佛人選，得由達賴喇嘛、駐藏大臣及濟嚨呼圖克圖等協商決定，並發給加蓋以上三人印章的執照。至於各小寺堪布活佛之人選，可依原例由達賴喇嘛決定。
（十九）政府之所有稅收，有以銀兩折交物品者，即照所定新舊章卡兌換之數，按新鑄舊鑄，分別折收，不得稍有浮多。至采買各物，亦須公平交易，不得苦累商民。
（二十）在濟嚨、聶拉木兩地方抽收大米、食鹽及各種物品之進出口稅。可依原例辦理，除非請示駐藏大臣同意，政府不得私自增加稅額。
（二十一）西藏之稅收、烏拉等各種差役，一般貧苦人民負擔苛重，富有人家向達賴喇嘛和班禪額爾德尼領得免役執照，達賴喇嘛之親屬及各大呼圖克圖亦領有免役執照。各噶倫、代本、大活佛之莊民也多領得免役執照。今後所有免役執照一律收回，使所有差役平均負擔。其因實有勞績，需要優待者，由達賴喇嘛和駐藏大臣協商發給免役執照。對新成立之兵員，由駐藏大臣和達賴喇嘛依照名冊一律發給免役執照。兵員出缺時，須將所發免役執照收回。
（二十二）達賴喇嘛所轄寺廟之活佛及喇嘛，一律詳造名冊，並由噶倫負責將全藏各呼圖克圖所屬寨落人戶詳細填造名冊，於駐藏大臣衙門和達賴喇嘛處各存一份。以便檢查。以後各寺喇嘛如有不領護照而私行外出者，一經查出，即懲辦該管堪布及劄薩等主腦人員。
（二十三）青海蒙古王公派人來藏，迎請有學問之活佛去彼念經祈禱，有些固然是通過駐藏大臣，但有些是私自前往，因而不易查考。以後青海蒙古王公前來迎請西藏活佛，須由西寧大臣行文駐藏大臣，由駐藏大臣發給通行護照，並行文西寧大臣，以便查考。到外方朝佛之活佛，亦得領取護照，始得通行。如若私行前往，一經査出，即懲罰該管堪布及主腦人員。
（二十四）依照舊例，來往派遣人伕烏拉，皆由達賴喇嘛發給掃標，流弊很大，噶倫、代本以及達賴喇嘛之親屬，都有私派烏拉用以運輸糧食用物，今後各活佛頭等因私外出時，一律不得派用烏拉。因公外出時，由駐藏大臣和達賴喇嘛發給加蓋印章之執票，沿途按照執票派用烏拉。
（二十五）對於打架、命案及偷盜等案件之處理，可以緣依舊規，但須分清罪行之大小輕重，秉公辦理。近年來噶倫及郎仔轄密本（拉薩市長）等，對案件之處理不惟不公，並額外罰款，還將所罰金銀牛羊等不交政府，而納入私囊。噶倫中利用權勢，對於地位低下之人，隨便加以罪名，呈報達賴喇嘛，沒收其財產者屢見不鮮。今後規定對犯人所罰款項，必須登記，呈繳駐藏大臣衙門。對犯罪者的處罰，都須經過駐藏大臣審批。沒收財產者，亦應呈報駐藏大臣，經過批準始能處理。今後無論公私人員，如有訴訟事務，均須依法公平處理。噶倫中如有依仗權勢，無端侵占人民財產者，一經查出，除將噶倫職務革除及沒收其財產外，並將所侵占的財產，全部退還本人，以儆效尤。
（二十六）每年操演軍隊所需用之彈藥，由噶廈派妥員攜帶駐藏大臣衙門之公文，前去工布地方製造，運至拉薩發給部隊。以前後藏番兵沒有火炮，現從製造十四門火炮中調兩門給後藏，以便在軍隊操演時試驗射擊，其餘都交給達賴喇嘛。
（二十七）過去噶倫及代本上任時，達賴喇嘛照例撥給公館及莊園，卸任時交回。近查有噶倫及代本已經卸任，而公館及莊園仍由家屬承受不交，政府又另外撥給。今後所有卸任之噶倫及代本，應將公館及莊園移交新任，不得據為私有。
（二十八）依照原例，應該發給活佛及喇嘛之俸銀，均有定時，近來多有提前發放情事，今後應按規定時間發放，絕對不得提前。希濟嚨呼圖立即進行調查，如發現提前發放俸銀，或未全部發放者，對負責人員予以處分。
（二十九）西藏各村落應交政府之賦稅、地租以及物品，鄰管各地多派僧官催繳，較遠者多派俗官催繳，近查僧俗官員和宗本中有少數壞人，將所收賦稅地租不交政府而入私囊，致逐年積欠者甚多，甚有催收本年各項賦稅時，預將明年各項賦稅提前催收情事。還有逃亡戶該負擔之賦稅，強加給住地戶負擔者，以致苛捐繁重，民不聊生，以來強佐派人催繳賦稅時，應按規定期限辦理。僧俗官員及宗本等隻準催清當年賦稅，不得提前催收來年賦稅。各村逃亡戶之負擔應予減免，俟該逃亡戶還鄉後照舊負擔。
注①《藏內善後章程二十九條》漢文原底至今尚未見到，這裏選錄的是牙含章在《達賴喇嘛傳》（1984年，人民出版社出版）一書中所載的漢文譯稿。見該書第62頁。