耶律那也率領數萬殘軍和六萬五千匹戰馬返回井陘關，在路上，不斷有人發病倒下，遼軍士兵毫不憐惜，一旦發病，立刻處死，屍體就地掩埋。
第三上午抵達井陘關時，發病的士兵越來越多，已經超過三千人，很多士兵都是混戰中被感染，也有不少患病士兵成功混進隊伍，感染了其他正常士兵。
這一次遼軍吸取了之前慘痛的教訓，不再隔離，發病士兵處死後屍體立刻燒掉或者深埋。
但耶律那也派去求降的士兵卻沒有回信，這是他之前用病人詐降留下的後遺症，送信士兵根本就靠近不了關隘，當場被宋軍射殺，也沒有宋軍士兵會去搜查他們身上的信件，遠遠地便噴上火油燒掉屍體。
又過了幾，疫情已經完全失控，發病的士兵不斷增加，很多剛剛還在談笑的士兵突然嘔吐腹瀉，強烈的不信任感在士兵之間迅速蔓延，每個人都在懷疑身邊同伴在掩飾病情，過去四時間，發病士兵便超過萬人，處死以及不甘被處死的反抗使遼軍陷入極度混亂之中。
這晚上，耶律那也悄然離開了軍隊，獨自一人向山腰處的井陘關走去。
距離井陘關還有幾百步，他便大喊：“我是遼軍主帥耶律那也，我沒有患病，懇請上麵弟兄讓我投降！”
“我是遼軍主帥耶律那也，我沒有患病，特來投降！”
他一路大喊，一路向關隘走去，他認為自己的主帥，宋軍會活捉他，但他還是失算了，在距離關隘還有七八十步時，上百支弩箭強勁射來，耶律那也躲閃不及，連中二十幾箭，當即倒地氣絕身亡。
黑暗中衝下來十幾名宋軍士兵，在七八步外便用皮囊火油噴射器射出一股股黑色火油，將耶律那也的屍體塗滿了火油，隨即射出一支火箭，屍體轟地燃燒起來，不多時，屍體便燒成了焦炭，最後隻剩下一些骨頭，被士兵掃下山崖。
宋軍唯恐疫病傳染上來，嚴格執行狄青的五條鐵律，不接受任何遼軍投降，屍體必須用火油徹底焚燒。
當晚上，山穀裏的遼軍發生了嚴重內亂，主帥耶律那也的失蹤成為遼軍內訌再度爆發的導火線，彼此極度不信任致使遼軍士兵開始自相殘殺，關城上的宋軍都被驚動了，狄青也聞訊趕來，站在城頭上向山下凝視。
山下一片漆黑，但隱隱可以聽見兵器的撞擊聲和士兵臨死前的慘叫聲。
統製楊度很驚訝，低聲道：“狄帥，這黑夜中什麼都看不清，怎麼分辨敵我？”
狄青搖了搖頭，麵色凝重，他緩緩道：“恐怕遼軍的內訌不是你我能想象的。”
“難道是沒有目標的亂砍亂殺？”另一名大將道。
狄青冷冷道：“他們都想活下去，都懷疑對方染病，那麼隻有殺掉對方，自己才有機會活下去。”
眾將都聽得匪夷所思，但隻有這樣似乎才合理，狄青隨即又令道：“嚴守關隘，不接受投降，不準任何人靠近關隘，靠近者一律射殺！”
遼軍的自相殘殺至到次日淩晨才漸漸停止，幸存的數千士兵受不了這種血腥壓抑，紛紛翻山越嶺尋找出路去了，井陘道內變得死一般寂靜。
十後，一場暴雨突然襲來，這場暴雨足足下了一一夜，一支由一千人人組成的探查隊下了關隘，到井陘內探查情況去了。
探查成員穿著皮靴和橡膠手套，穿著三層油布長袍，還有帽子，把自己遮得嚴嚴實實，每個人帶厚厚的綿布口罩，中間還有碳粉，每個還戴著玻璃眼罩，這算是最原始的生化防護服，
山穀內的情況觸目驚心，已經看不到一個活人，到處是遼軍士兵的屍體，從井陘關走到娘子關，確定沒有幸存士兵，宋軍開始撤軍，大量士兵撤出井陘關和娘子關。
狄青隨即又出動三千士兵穿上防疫服進入井陘清理屍體，士兵們開始堆積屍體進行焚燒，整整處理了半個月，才將十餘萬遼軍的屍體全部焚燒深埋，宋軍收集了大量的兵器盔甲，煮水消毒後帶出關隘。