準確的說，正親町上皇下達的禦教書也是傳檄四方，隻可惜大部分都被畿內的織田家武士給阻攔住，隻有足利義時這一路走特殊路徑，以及從舞鶴港向西國、九州所傳的幾路院宣沒有被阻撓，即便如此，足利義時公布院宣的那一刻，也讓世人知道京都有怎樣一群喪心病狂之輩。
這場大亂被稱作永祿禁中之變，足利義昭夥同織田信長一黨，在正旦大朝會的當天突襲大內裏，將百官囚於宮中不得脫身，強令正親町天皇寫下退位詔書，而後簇擁著年輕的誠仁親王走上皇位，足利義昭與二條晴良全程立於左右，而織田信長更是趾高氣昂的仗劍入宮，其驕傲的架勢不下當年鼎盛時期的平清盛一族。
足利義昭瘋了，起碼足利義時是這麼認為的，不過他本人並沒有瘋掉的自知之明，而是在擁立新天皇以後，立刻晉升有功之臣織田信長的官位至従三位參議，在短短的兩個月時間裏，織田信長就從一介正五位下彈正少忠，晉升正四位上彈正大弼，又晉升到従三位參議。
這一切簡直就像做夢一樣，足利義昭也不會少得了犒勞自己，反正天皇也是自己立的，很幹脆的就自己寫下一份晉升令讓天皇簽名，從原先的従三位権大納言，躍升至従二位內大臣、左近衛大將，從低級公卿一步跨入高級公卿的行列，簡直堪比一步登天。
這晉升速度還不算誇張的，最初他是想一口氣寫個従一位右大臣，像他死去的倒黴兄長足利義輝看齊，結果被二條晴良毫不猶豫的拒絕，這位關白還有點良知，知道規矩不能這麼肆無忌憚的破壞，否則公卿豈不是堪比街邊賣菜的老農民毫無權威可言。
犒賞織田信長従三位參議還不夠，足利義昭又給織田信長加了一個名份，封織田信長為副將軍，其子織田信忠為従五位下侍從，並享受三管領家格，織田家一係的武士個個受封，柴田勝家晉升従五位下修理亮，丹羽長秀晉升従五位下越前守，就連獻策有功的木下秀吉也受到封賞，晉升従五位下築前守，並改名為羽柴秀吉。
明智光秀也得到封賞，得到正五位上刑部大輔的封賞，這還是因為足利義昭覺得這家夥背叛自己的原因，否則依照這個將軍好大喜功的性子，給個従四位下也不過分，真可謂是一人得道雞犬升天，人人得賞個個封官，反正朝廷就相當於他們家開的。
這種情況下，新天皇就變成徹頭徹尾的傀儡，好歹以前還有點權力寫個詔令派個大臣去化化緣，或者派出清華家、大臣家的公卿到遠國找各地大名領主談判，你們占的莊園以前是天皇家的禦料所，朝廷厚道也不打算要回那些莊園，但是怎麼也得給朝廷點禦料錢。
現在可到好，天皇越混越回去，連化緣的機會都沒有，幕府直接掐斷天皇與公卿的來往，內廷諸事問於二條晴良，外廷諸事問於足利義昭，兵勢諸事問於織田信長，京都內外大權就操控在這三人之手。
……
永祿十二年正月十八日，正是禁中之變結束的半個月，織田信長聚集畿內四方之軍勢共八萬人向阪本城發起進攻，正急紅眼要爭功的淺井長政、朝倉義景所部兩萬軍勢充當先鋒，對伊香郡展開攻擊，如饑餓的狼犬撲食獵物貪婪而殘暴，中條時秀見勢不妙立刻收緊軍勢燒毀城砦，大軍退回相對安全的高島郡繼續籠城。
而後織田軍大舉進攻，九鬼嘉隆所部水軍封鎖水路，以主力六萬進攻大津城，中條時秀拚死抵抗卻擋不住四麵八方如潮湧般的軍勢，宇佐山城危急重重，大津城危如累卵，阪本城也是危在旦夕，中條時秀一邊喝令近江國中征發軍役，一邊發出一道道求援信疾馳向關東，轉眼間整個東海道乃至天下盡人皆知。
服部保長拚死營救上皇的事跡漸為人知，其子服部保元、服部保正、服部保俊三兄弟，及其配下忍者一百二十餘人血灑大內裏，為拯救正親町上皇被源源不斷的織田軍亂刀斬殺，服部保長本人也是身負重傷，護送正親町上皇逃入阪本就昏迷不醒。