飽食之後，吉良義時安排水軍眾封鎖鴨川航道，務必要保證鬆永長賴的兩千軍勢無法通過鴨川，然後留下受損嚴重的殘陣和傷兵，讓他們看押戰敗俘虜的三好家殘餘軍勢，自己則親自帶領餘下的不足四千軍勢乘迴船沿著鴨川逆流而上。
在穿過三條大橋後開始陸續在東岸登陸，根據服部保長反饋的消息，三好長逸正在銀閣寺外布陣，先期的五千軍勢正在攻擊山上的中尾城，而他帶著本陣三千軍勢坐鎮銀閣寺。
此時大約下午三點左右，三好長逸展開例行公事的製壓，自己正在慈照寺中休息，他每天都會命令大軍出陣攻擊中尾城，剛開始的半個月裏，三好長逸還趁著統領大軍的新鮮感天天上山打中尾城，後來新鮮感一過就怠倦下來，貪圖慈照寺的繁華禦所每日在裏麵花天酒地把好好的寺院搞的烏煙瘴氣，真是人見人厭。
在得到這個寶貴的情報之後，吉良義時抓住了機會，立刻帶著四千軍勢直撲慈照寺，打了三好長逸一個措手不及，在本陣裏的三好家軍勢隻有少數人穿戴整齊，大部分都放鬆警惕的休憩，所以吉良家的軍勢突襲而來的時候，本陣立刻陷入了慌亂。
吉良義時擔心這廝賴在慈照寺裏負隅頑抗，萬一來個玉石俱焚的燒寺之舉那可就得不償失，於是他就命令大軍圍剿慈照寺的時候，特意圍三闕一放他們逃走，而且因為兵力不足，近江備長途奔波過於疲憊的原因，吉良義時隻命令強攻正麵。
用鐵炮隊與弓箭隊的遠程打擊力不斷消磨他們的抵抗意誌，一時間敢於反抗衝出來的三好亂軍死傷無數，聽著雷鳴般爆響的聲音，三好長逸一邊命令所有人拚死抵抗，一邊召集家臣商議對策。
“現在幕府軍打上門來了！快說本家怎麼辦？”
三好長逸的一門侄子，三好兵庫助長勝說道：“為今之計隻有與大軍彙合再一鼓作氣殺回來了吧！”
“是啊！也隻有這樣了！”幾名家臣都是平庸之輩，否則也不會跟著三好長逸做家臣，有能耐的都想去三好長慶那做直臣，誰會跟著這個老家夥混吃混喝，寺內的僧人把禪房的大門一鎖不理他們，三好長逸也頗覺得無計可施。
“難道本家真得要逃出去嗎？”這位三好家地位舉足輕重的一門長老，來回踱著步子下不出決斷，說到底他還是心存幻想盼著山上的軍勢能及時趕回來救援。
他的猶豫沒持續多久，隱忍大半天的三河兩備隊火力全開，其中槍半藏渡邊高綱一人當先，帶領兩百精銳足輕成鋒矢陣衝鋒在前，手中的大槍連削帶刺片刻間殺死五名三好家的武士，接著大喝一聲：“渡邊槍半藏討取三好家五名武士！”
戰局瞬息萬變，在渡邊高綱乘勝突入陣中連斬數人的時候，吉良義時的本陣也在不斷向前移動，內藤正成匹馬單弓兩壺箭掛在馬鞍上，手中的長弓如時開時合，任何一個敢於靠近本陣的三好家武士都成了他的箭下亡魂。
緊急抽調來的三百鐵炮隊也有不俗的表現，瀧川益重指揮著鐵炮隊做一次次齊射，麵對三好家的足輕紮堆衝鋒時，不急不躁的端槍瞄準，在距離十間的距離時才開始射擊，雷鳴般的震響帶著漫天飄起的煙霧遮天蔽日，一輪齊射就打死超過五六十人。